Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms