Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cep78Q6IRU7 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms