Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.05■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ParpbpQ6IRT3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms