Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Krt39Q6IFX4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Krt39Q6IFX4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Krt39Q6IFX4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Krt39Q6IFX4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Krt39Q6IFX4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Krt39Q6IFX4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt39Q6IFX4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt39Q6IFX4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt39Q6IFX4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt39Q6IFX4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt39Q6IFX4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt39Q6IFX4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt39Q6IFX4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt39Q6IFX4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt39Q6IFX4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt39Q6IFX4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt39Q6IFX4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt39Q6IFX4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt39Q6IFX4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt39Q6IFX4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt39Q6IFX4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt39Q6IFX4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt39Q6IFX4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt39Q6IFX4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt39Q6IFX4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt39Q6IFX4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt39Q6IFX4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt39Q6IFX4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt39Q6IFX4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt39Q6IFX4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt39Q6IFX4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt39Q6IFX4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt39Q6IFX4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt39Q6IFX4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt39Q6IFX4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt39Q6IFX4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt39Q6IFX4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt39Q6IFX4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt39Q6IFX4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt39Q6IFX4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt39Q6IFX4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt39Q6IFX4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt39Q6IFX4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt39Q6IFX4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms