Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgap20Q6IFT4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms