Protein–RNA interactions for Protein: Q6GSS7

Hist2h2aa1, Histone H2A type 2-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist2h2aa1Q6GSS7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms