Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Carmil1Q6EDY6 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Carmil1Q6EDY6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Carmil1Q6EDY6 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Carmil1Q6EDY6 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Carmil1Q6EDY6 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Carmil1Q6EDY6 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Carmil1Q6EDY6 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Carmil1Q6EDY6 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Carmil1Q6EDY6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Carmil1Q6EDY6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Carmil1Q6EDY6 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Carmil1Q6EDY6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Carmil1Q6EDY6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Carmil1Q6EDY6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Carmil1Q6EDY6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Carmil1Q6EDY6 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Carmil1Q6EDY6 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Carmil1Q6EDY6 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Carmil1Q6EDY6 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Carmil1Q6EDY6 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Carmil1Q6EDY6 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Carmil1Q6EDY6 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Carmil1Q6EDY6 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Carmil1Q6EDY6 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Carmil1Q6EDY6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Carmil1Q6EDY6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Carmil1Q6EDY6 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Carmil1Q6EDY6 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Carmil1Q6EDY6 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Carmil1Q6EDY6 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Carmil1Q6EDY6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Carmil1Q6EDY6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Carmil1Q6EDY6 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms