Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Smarca2Q6DIC0 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Smarca2Q6DIC0 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Smarca2Q6DIC0 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Smarca2Q6DIC0 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Smarca2Q6DIC0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Smarca2Q6DIC0 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Smarca2Q6DIC0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Smarca2Q6DIC0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Smarca2Q6DIC0 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Smarca2Q6DIC0 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Smarca2Q6DIC0 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Smarca2Q6DIC0 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms