Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Jmjd1cQ69ZK6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Jmjd1cQ69ZK6 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Jmjd1cQ69ZK6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Jmjd1cQ69ZK6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Jmjd1cQ69ZK6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Jmjd1cQ69ZK6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Jmjd1cQ69ZK6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Jmjd1cQ69ZK6 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Jmjd1cQ69ZK6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Jmjd1cQ69ZK6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Jmjd1cQ69ZK6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Jmjd1cQ69ZK6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Jmjd1cQ69ZK6 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Jmjd1cQ69ZK6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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