Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB8

Zcchc2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc2Q69ZB8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zcchc2Q69ZB8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms