Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z66

Mysm1, Histone H2A deubiquitinase MYSM1, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mysm1Q69Z66 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Mysm1Q69Z66 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mysm1Q69Z66 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mysm1Q69Z66 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mysm1Q69Z66 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mysm1Q69Z66 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mysm1Q69Z66 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mysm1Q69Z66 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mysm1Q69Z66 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mysm1Q69Z66 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mysm1Q69Z66 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mysm1Q69Z66 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mysm1Q69Z66 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mysm1Q69Z66 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mysm1Q69Z66 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Mysm1Q69Z66 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mysm1Q69Z66 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms