Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms