Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CltcQ68FD5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms