Protein–RNA interactions for Protein: Q64HY3

Sp9, Transcription factor Sp9, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp9Q64HY3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Sp9Q64HY3 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Sp9Q64HY3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Sp9Q64HY3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Sp9Q64HY3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms