Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc3Q64519 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms