Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms