Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms