Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms