Protein–RNA interactions for Protein: Q62413

Epha6, Ephrin type-A receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha6Q62413 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epha6Q62413 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms