Protein–RNA interactions for Protein: Q62226

Shh, Sonic hedgehog protein, mousemouse

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShhQ62226 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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ShhQ62226 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ShhQ62226 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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ShhQ62226 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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ShhQ62226 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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ShhQ62226 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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ShhQ62226 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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ShhQ62226 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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ShhQ62226 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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ShhQ62226 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ShhQ62226 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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