Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpaQ62189 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms