Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssr4Q62186 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssr4Q62186 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms