Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms