Protein–RNA interactions for Protein: Q62147

Sspn, Sarcospan, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SspnQ62147 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SspnQ62147 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SspnQ62147 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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SspnQ62147 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SspnQ62147 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SspnQ62147 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SspnQ62147 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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