Protein–RNA interactions for Protein: Q61334

Bcap29, B-cell receptor-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcap29Q61334 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bcap29Q61334 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bcap29Q61334 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bcap29Q61334 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bcap29Q61334 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bcap29Q61334 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bcap29Q61334 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bcap29Q61334 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Bcap29Q61334 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bcap29Q61334 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bcap29Q61334 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bcap29Q61334 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Bcap29Q61334 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bcap29Q61334 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bcap29Q61334 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Bcap29Q61334 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Bcap29Q61334 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bcap29Q61334 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bcap29Q61334 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bcap29Q61334 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bcap29Q61334 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bcap29Q61334 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bcap29Q61334 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bcap29Q61334 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bcap29Q61334 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bcap29Q61334 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bcap29Q61334 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Bcap29Q61334 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Bcap29Q61334 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Bcap29Q61334 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Bcap29Q61334 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Bcap29Q61334 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Bcap29Q61334 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Bcap29Q61334 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Bcap29Q61334 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Bcap29Q61334 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Bcap29Q61334 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Bcap29Q61334 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Bcap29Q61334 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Bcap29Q61334 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Bcap29Q61334 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Bcap29Q61334 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Bcap29Q61334 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Bcap29Q61334 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms