Protein–RNA interactions for Protein: Q60769

Tnfaip3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip3Q60769 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfaip3Q60769 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfaip3Q60769 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfaip3Q60769 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfaip3Q60769 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfaip3Q60769 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tnfaip3Q60769 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfaip3Q60769 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfaip3Q60769 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfaip3Q60769 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfaip3Q60769 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfaip3Q60769 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfaip3Q60769 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfaip3Q60769 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfaip3Q60769 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfaip3Q60769 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfaip3Q60769 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfaip3Q60769 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfaip3Q60769 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfaip3Q60769 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfaip3Q60769 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfaip3Q60769 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfaip3Q60769 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfaip3Q60769 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfaip3Q60769 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfaip3Q60769 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfaip3Q60769 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfaip3Q60769 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfaip3Q60769 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfaip3Q60769 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfaip3Q60769 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfaip3Q60769 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tnfaip3Q60769 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfaip3Q60769 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfaip3Q60769 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfaip3Q60769 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfaip3Q60769 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfaip3Q60769 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfaip3Q60769 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfaip3Q60769 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfaip3Q60769 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfaip3Q60769 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfaip3Q60769 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfaip3Q60769 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfaip3Q60769 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfaip3Q60769 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tnfaip3Q60769 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfaip3Q60769 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tnfaip3Q60769 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfaip3Q60769 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfaip3Q60769 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfaip3Q60769 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfaip3Q60769 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfaip3Q60769 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfaip3Q60769 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfaip3Q60769 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfaip3Q60769 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms