Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Epha1Q60750 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Epha1Q60750 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Epha1Q60750 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Epha1Q60750 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Epha1Q60750 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Epha1Q60750 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Epha1Q60750 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Epha1Q60750 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Epha1Q60750 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Epha1Q60750 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Epha1Q60750 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Epha1Q60750 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Epha1Q60750 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Epha1Q60750 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Epha1Q60750 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Epha1Q60750 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Epha1Q60750 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Epha1Q60750 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Epha1Q60750 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Epha1Q60750 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Epha1Q60750 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Epha1Q60750 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Epha1Q60750 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Epha1Q60750 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Epha1Q60750 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Epha1Q60750 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Epha1Q60750 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Epha1Q60750 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Epha1Q60750 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Epha1Q60750 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Epha1Q60750 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Epha1Q60750 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Epha1Q60750 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Epha1Q60750 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Epha1Q60750 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Epha1Q60750 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Epha1Q60750 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Epha1Q60750 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Epha1Q60750 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Epha1Q60750 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Epha1Q60750 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Epha1Q60750 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Epha1Q60750 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Epha1Q60750 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Epha1Q60750 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Epha1Q60750 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Epha1Q60750 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Epha1Q60750 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Epha1Q60750 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Epha1Q60750 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Epha1Q60750 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Epha1Q60750 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Epha1Q60750 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Epha1Q60750 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Epha1Q60750 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Epha1Q60750 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Epha1Q60750 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Epha1Q60750 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Epha1Q60750 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Epha1Q60750 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Epha1Q60750 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epha1Q60750 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epha1Q60750 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epha1Q60750 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epha1Q60750 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epha1Q60750 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epha1Q60750 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epha1Q60750 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epha1Q60750 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Epha1Q60750 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epha1Q60750 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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