Protein–RNA interactions for Protein: Q60738

Slc30a1, Zinc transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc30a1Q60738 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc30a1Q60738 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc30a1Q60738 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc30a1Q60738 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc30a1Q60738 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc30a1Q60738 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc30a1Q60738 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc30a1Q60738 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc30a1Q60738 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc30a1Q60738 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc30a1Q60738 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc30a1Q60738 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc30a1Q60738 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc30a1Q60738 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc30a1Q60738 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc30a1Q60738 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc30a1Q60738 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc30a1Q60738 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc30a1Q60738 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc30a1Q60738 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc30a1Q60738 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc30a1Q60738 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc30a1Q60738 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc30a1Q60738 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc30a1Q60738 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc30a1Q60738 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc30a1Q60738 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc30a1Q60738 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc30a1Q60738 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc30a1Q60738 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc30a1Q60738 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc30a1Q60738 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc30a1Q60738 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc30a1Q60738 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc30a1Q60738 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc30a1Q60738 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc30a1Q60738 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc30a1Q60738 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc30a1Q60738 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc30a1Q60738 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc30a1Q60738 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc30a1Q60738 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc30a1Q60738 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc30a1Q60738 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc30a1Q60738 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc30a1Q60738 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc30a1Q60738 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc30a1Q60738 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc30a1Q60738 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc30a1Q60738 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc30a1Q60738 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc30a1Q60738 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc30a1Q60738 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc30a1Q60738 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc30a1Q60738 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc30a1Q60738 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc30a1Q60738 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc30a1Q60738 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc30a1Q60738 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc30a1Q60738 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc30a1Q60738 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc30a1Q60738 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc30a1Q60738 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc30a1Q60738 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc30a1Q60738 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc30a1Q60738 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc30a1Q60738 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc30a1Q60738 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc30a1Q60738 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc30a1Q60738 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc30a1Q60738 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc30a1Q60738 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc30a1Q60738 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc30a1Q60738 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc30a1Q60738 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc30a1Q60738 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc30a1Q60738 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc30a1Q60738 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc30a1Q60738 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc30a1Q60738 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc30a1Q60738 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc30a1Q60738 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc30a1Q60738 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc30a1Q60738 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc30a1Q60738 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc30a1Q60738 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc30a1Q60738 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc30a1Q60738 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc30a1Q60738 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc30a1Q60738 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc30a1Q60738 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc30a1Q60738 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc30a1Q60738 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc30a1Q60738 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc30a1Q60738 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc30a1Q60738 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc30a1Q60738 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc30a1Q60738 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc30a1Q60738 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc30a1Q60738 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms