Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms