Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXY1

Specc1, Cytospin-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1Q5SXY1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms