Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Brip1Q5SXJ3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms