Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myh1Q5SX40 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms