Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms