Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms