Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ5

Tns3, Tensin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tns3Q5SSZ5 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tns3Q5SSZ5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms