Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms