Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
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Lrrc47Q505F5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc47Q505F5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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