Protein–RNA interactions for Protein: Q4VAA7

Snx33, Sorting nexin-33, mousemouse

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx33Q4VAA7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Snx33Q4VAA7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Snx33Q4VAA7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Snx33Q4VAA7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx33Q4VAA7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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