Protein–RNA interactions for Protein: Q4U4S6

Xirp2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp2Q4U4S6 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms