Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam220aQ3ZN08 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
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