Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms