Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0V0

Ldlrad2, Low density lipoprotein receptor A domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldlrad2Q3V0V0 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ldlrad2Q3V0V0 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ldlrad2Q3V0V0 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ldlrad2Q3V0V0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ldlrad2Q3V0V0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ldlrad2Q3V0V0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ldlrad2Q3V0V0 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ldlrad2Q3V0V0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ldlrad2Q3V0V0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ldlrad2Q3V0V0 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ldlrad2Q3V0V0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ldlrad2Q3V0V0 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ldlrad2Q3V0V0 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ldlrad2Q3V0V0 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ldlrad2Q3V0V0 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ldlrad2Q3V0V0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ldlrad2Q3V0V0 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ldlrad2Q3V0V0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ldlrad2Q3V0V0 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ldlrad2Q3V0V0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ldlrad2Q3V0V0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ldlrad2Q3V0V0 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ldlrad2Q3V0V0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ldlrad2Q3V0V0 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ldlrad2Q3V0V0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldlrad2Q3V0V0 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldlrad2Q3V0V0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldlrad2Q3V0V0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldlrad2Q3V0V0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldlrad2Q3V0V0 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldlrad2Q3V0V0 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldlrad2Q3V0V0 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldlrad2Q3V0V0 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldlrad2Q3V0V0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldlrad2Q3V0V0 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldlrad2Q3V0V0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldlrad2Q3V0V0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldlrad2Q3V0V0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldlrad2Q3V0V0 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldlrad2Q3V0V0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldlrad2Q3V0V0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldlrad2Q3V0V0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldlrad2Q3V0V0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldlrad2Q3V0V0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldlrad2Q3V0V0 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldlrad2Q3V0V0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldlrad2Q3V0V0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldlrad2Q3V0V0 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldlrad2Q3V0V0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ldlrad2Q3V0V0 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldlrad2Q3V0V0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms