Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Garnl3Q3V0G7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms