Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc27Q3V036 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc27Q3V036 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms