Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

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Length 77 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Gm26836-201ENSMUST00000181056 1568 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Zfp54-202ENSMUST00000165230 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Slc22a13-201ENSMUST00000084797 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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