Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms