Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms