Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E330034G19RikQ3UWX6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E330034G19RikQ3UWX6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E330034G19RikQ3UWX6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E330034G19RikQ3UWX6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E330034G19RikQ3UWX6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E330034G19RikQ3UWX6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E330034G19RikQ3UWX6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E330034G19RikQ3UWX6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E330034G19RikQ3UWX6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E330034G19RikQ3UWX6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E330034G19RikQ3UWX6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E330034G19RikQ3UWX6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E330034G19RikQ3UWX6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E330034G19RikQ3UWX6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E330034G19RikQ3UWX6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E330034G19RikQ3UWX6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E330034G19RikQ3UWX6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E330034G19RikQ3UWX6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E330034G19RikQ3UWX6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E330034G19RikQ3UWX6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E330034G19RikQ3UWX6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E330034G19RikQ3UWX6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E330034G19RikQ3UWX6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
E330034G19RikQ3UWX6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E330034G19RikQ3UWX6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E330034G19RikQ3UWX6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
E330034G19RikQ3UWX6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E330034G19RikQ3UWX6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E330034G19RikQ3UWX6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E330034G19RikQ3UWX6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E330034G19RikQ3UWX6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E330034G19RikQ3UWX6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E330034G19RikQ3UWX6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
E330034G19RikQ3UWX6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E330034G19RikQ3UWX6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E330034G19RikQ3UWX6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E330034G19RikQ3UWX6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E330034G19RikQ3UWX6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E330034G19RikQ3UWX6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
E330034G19RikQ3UWX6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E330034G19RikQ3UWX6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E330034G19RikQ3UWX6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E330034G19RikQ3UWX6 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E330034G19RikQ3UWX6 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E330034G19RikQ3UWX6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
E330034G19RikQ3UWX6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E330034G19RikQ3UWX6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E330034G19RikQ3UWX6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E330034G19RikQ3UWX6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E330034G19RikQ3UWX6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E330034G19RikQ3UWX6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E330034G19RikQ3UWX6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E330034G19RikQ3UWX6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E330034G19RikQ3UWX6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E330034G19RikQ3UWX6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
E330034G19RikQ3UWX6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E330034G19RikQ3UWX6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E330034G19RikQ3UWX6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E330034G19RikQ3UWX6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E330034G19RikQ3UWX6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E330034G19RikQ3UWX6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E330034G19RikQ3UWX6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
E330034G19RikQ3UWX6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E330034G19RikQ3UWX6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E330034G19RikQ3UWX6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E330034G19RikQ3UWX6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
E330034G19RikQ3UWX6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
E330034G19RikQ3UWX6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
E330034G19RikQ3UWX6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
E330034G19RikQ3UWX6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
E330034G19RikQ3UWX6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
E330034G19RikQ3UWX6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
E330034G19RikQ3UWX6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
E330034G19RikQ3UWX6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
E330034G19RikQ3UWX6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E330034G19RikQ3UWX6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E330034G19RikQ3UWX6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E330034G19RikQ3UWX6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E330034G19RikQ3UWX6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E330034G19RikQ3UWX6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E330034G19RikQ3UWX6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E330034G19RikQ3UWX6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E330034G19RikQ3UWX6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E330034G19RikQ3UWX6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E330034G19RikQ3UWX6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E330034G19RikQ3UWX6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E330034G19RikQ3UWX6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E330034G19RikQ3UWX6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E330034G19RikQ3UWX6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E330034G19RikQ3UWX6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E330034G19RikQ3UWX6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E330034G19RikQ3UWX6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E330034G19RikQ3UWX6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E330034G19RikQ3UWX6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E330034G19RikQ3UWX6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms