Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW98

Clca4b, Chloride channel accessory 4B, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4bQ3UW98 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms