Protein–RNA interactions for Protein: Q3USQ7

Syndig1l, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1lQ3USQ7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syndig1lQ3USQ7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syndig1lQ3USQ7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms